《表4 桉树树种的特有SNP位点统计》

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《基于ddGBS的桉树SNP挖掘和系统进化分析》


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样品物有SNP:各树种两个样品的特有SNP总数,包括样品1特有SNP位点数、样品2特有SNP位点数及两个样品共有的特有SNP位点数。物种特有SNP:物种中两个样品相比于其他13个物种的特有SNP位点数。

基于42 222个高质量SNP,统计各树种的特有SNP位点(即仅在该树种存在的SNP位点)数目(表4),分别包括样品特有SNP位点数目和物种特有SNP位点数目。14种桉树的SNP数目存在差异,其中克蒂斯桉(3 348个)、方格皮桉(1 509个)和王桉(1 610个)的特有SNP较多,柠檬桉(841个)、加拉桉(593个)次之,粗皮桉(57个)和细叶桉(56个)最少。14种桉树的核苷酸多样性值主要分布在1.03×10-6~1.07×10-4之间,最大值为1.95×10-4,平均值为2.82×10-5(图2)。