《表3 包装纸箱的密度：基于ddGBS的桉树SNP挖掘和系统进化分析》

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《基于ddGBS的桉树SNP挖掘和系统进化分析》

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利用GATK软件共检测到2 606 828个SNP位点，经Vcftools软件对SNP位点数据进过滤后，保留下42 222个高可信度SNP。根据绘制的SNP位点在巨桉参考基因组上的分布（图1）可见，SNP位点在染色体上分布较为均匀，约99.6%(42 059）的SNP成功定位在巨桉参考基因组11条染色体上，仅有约0.4%(163个）的SNP无法定位到11条染色体上。对高可信度SNP进行功能注释，统计结果（表3）表明：SNP标记约有29.0%位于外显子区域，内含子区、上游和下游区域分别有11.3%、13.2%和12.4%，5′和3′端的UTR区含有5.1%的SNP位点，剪切位点为2.2%，基因间区仅有1.9%。