《表3 SNP位点统计表:基于高通量测序的都匀地区福鼎大白种茶树根茎叶分析》

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《基于高通量测序的都匀地区福鼎大白种茶树根茎叶分析》


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利用GATK (Mckenna et al.,2010)软件对Hisat2比对结果中的SNP位点和In Del进行识别,进而分析基因表达水平和基因功能,SNP分析表明基因区SNP位点数多于基因间区,转换型SNP多于颠换型SNP(表3)。In Del主要存在于内含子区和基因间区(图1)。