《表1 24个材料田间鉴定结果与SNP鉴定比较》

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《陆地棉耐盐相关SNP筛选和鉴定》


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用聚丙烯酰胺凝胶电泳检测12个非同义SNP在24个材料中的多态性。12对引物中,SNP i06704Gh和i40107 Gh对应的引物在24个实验材料中有多态性(表1)。SNP i06704Gh所对应的引物9,对基因组扩增得到114 bp的序列,用限制性内切酶PstⅠ处理后,若SNP位点碱基为C,则该114 bp的序列能够被切开,若该位点碱基为T,则该序列不能被切开(图3)。i40107Gh对应的引物12,对基因组扩增可得到长度为86 bp的序列,接着用限制性内切酶NlaⅢ酶切。若此SNP位点碱基为T,则形成NlaⅢ酶切位点CATG,DNA序列能被限制性内切酶NlaⅢ切断,产生两段长度分别为59 bp和27 bp的序列,SNP位点碱基为G则不能。所以,有一条59 bp条带的材料SNP位点的碱基应该是GT(图3),否则SNP位点碱基是GG。