《表2 31℃下差异表达lncRNA引物序列》
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《不同温度下TMV侵染枯斑三生烟的LncRNA差异表达》
使用Primer Premier(V6.0.0)对各处理DElncRNA进行荧光定量引物设计(表1、表2)。使用ChamQ Universal SYBR qPCR Master Mix(Vazyme,中国)实时荧光定量试剂盒,利用Applied Biosystems 7500 Fast Real-Time PCR System(ABI,美国)进行q RT-PCR反应。总反应体系为20μL:SYBR qPCR Master Mix 10μL,PCR正反向引物各0.4μL,作为模板的逆转录所得cDNA 2μL,RNase-free water 7.2μL。扩增条件为95℃预变性30 s;95℃反应10 s和60℃反应30 s,循环40次;95℃反应15 s和60℃反应1 min,95℃反应15 s分析融解曲线。依据融解曲线分析引物的特异性。根据红花烟草肌动蛋白(actin)序列(序列号:GQ339768),设计荧光定量引物(正向引物:5′-TGAGACATTCAACGTTCCGGC-3′,反向引物:5′-GTTAGGTCACGGCCAGCAAG-3′)。以actin为内参,根据2-ΔΔCt法[25]计算基因相对定量的表达,借助SPSS(V24.0.0)进行数据分析,利用Excel 2016绘制图表,得到DElnc RNA表达情况,对测序结果进行验证。
图表编号 | XD00142692700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.01 |
作者 | 贾海燕、宋丽云、徐翔、解屹、张超群、刘天波、赵存孝、申莉莉、王杰、李莹、王凤龙、杨金广 |
绘制单位 | 中国农业科学院烟草研究所、烟草行业病虫害监测与综合治理重点开放实验室、中国农业科学院烟草研究所、烟草行业病虫害监测与综合治理重点开放实验室、中国农业科学院烟草研究所、烟草行业病虫害监测与综合治理重点开放实验室、中国农业科学院烟草研究所、烟草行业病虫害监测与综合治理重点开放实验室、江西省烟叶科学研究所、中国烟草总公司中南农业试验站、甘肃省烟草公司庆阳市公司、中国农业科学院烟草研究所、烟草行业病虫害监测与综合治理重点开放实验室、中国农业科学院烟草研究所、烟草行业病虫害监测与综合治理重点开放实验室、中国农业科学 |
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