《表1 引物序列:2型糖尿病患者外周血环状RNA差异表达分析》
抽取受试者静脉血5 ml放入EDTA抗凝管,颠倒混匀后于―20℃或―80℃冰箱保存备用;Trizol提取血中总RNA,严格按照试剂盒说明书操作;总RNA使用分光光度计测定浓度、纯度;合格样品使用RNase R去除线性RNA后进行c DNA扩增和荧光标记,使用Agilent系统进行杂交并清洗,于Axon基因芯片扫描仪上成像,Gene Pix Pro 6.0软件分析circ RNA差异表达谱。两组分别随机选取3例(按照实际年龄匹配)共6张芯片检测circ RNA[8-9],获得circ RNAs差异表达谱后扩大样本量。芯片实验初筛结果中进一步选择差异倍数(FC)较大的circ RNAs进行q RT-PCR验证。所有引物序列见表1。总RNA逆转录得到c DNA模板,采用7900型号q RT-PCR仪进行扩增,circ RNA表达以U6作为内参进行标准化,2-△△Ct计算FC[10]。运用基因软件进行预测,挑选出5个最高匹配值mi RNA结合位点。采用DAVID软件对芯片和q RT-PCR实验结果一致的circ RNAs进行数据分析,计算分类、包含基因、P值等内容,再将结果导入Pathway Studio 5.0软件,自动输出相关的信号通路和P值。
图表编号 | XD00215932200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.12.20 |
作者 | 徐文超、刘建平、狄静、徐磊、许峻、姚杏娟 |
绘制单位 | 常州市疾病预防控制中心、常州市疾病预防控制中心 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |