《表1 在胃癌组织中差异表达的环状RNA》

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《基于GEO数据库分析circRNAs在胃癌组织中的表达》

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通过对数据库GSE78092、GSE89143和GSE83521进行合并分析，发现共有1 708个环状RNA，至少2个数据库都存在的环状RNA有343个，其中15个环状RNA为3个数据库共同包含（图1A）。进行差异筛选后，发现共有508个差异表达的环状RNA，至少2个数据库都存在的环状RNA有31个，其中2个环状RNA为3个数据库共同包含（图1B）。但在差异表达的环状RNA中，有10个环状RNA在上述数据库中表达不一致，分别为hsa＿circ＿0092360、hsa＿circ＿0059369、hsa＿circ＿0032683、hsa＿circ＿0009594、hsa＿circ＿0007518、hsa＿circ＿0005927、hsa＿circ＿0005051、hsa＿circ＿0001789、hsa＿circ＿0000554和hsa＿circ＿0000519（图1C）。将上述10个环状RNA去除后再次分析，发现在胃癌组织中上调的环状RNA有125个，下调的373个，其中至少2个数据库都存在的环状RNA有21个，且只有hsa＿circ＿0050102表达上调，另外hsa＿circ＿0067934和hsa＿circ＿0013048是3个数据库中均包含的，且在胃癌组织中表达下调（图1D，表1）。