《表1 引物序列:用高通量测序技术研究松辽黑猪与长白猪背最长肌mRNA和lncRNA的差异表达》

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《用高通量测序技术研究松辽黑猪与长白猪背最长肌mRNA和lncRNA的差异表达》


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为了验证测序结果的可靠性,对差异表达的mRNA和lncRNA进行验证。挑选10个差异表达的mRNA和10个差异表达的lncRNA,包括5个上调基因和5个下调基因,进行RT-PCR验证。RT-PCR所使用的cDNA由高通量测序使用的剩余的RNA样品反转录产生。设计所挑选基因的引物,使用甘油醛-3-磷酸脱氢酶(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase,GAPDH)基因作为内部对照,引物均由上海生工合成(表1)。进行RT-PCR,并使用2-ΔΔCt方法计算样品之间基因的相对表达水平。