《表1.本文所用引物：链霉菌IMS002的分类鉴定及其抗真菌活性物质解析》

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《链霉菌IMS002的分类鉴定及其抗真菌活性物质解析》

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接种链霉菌IMS002孢子于YEME培养基中，28°C振荡培养2 d，然后收集菌体进行链霉菌总DNA少量制备[17]。提取该菌株基因组DNA，并通过异丙醇进行沉淀。以该菌株基因组DNA为模板，采用表1中的引物进行PCR扩增。将扩增产物送到金唯智生物科技公司（北京）进行测序，获得16S rDNA（MK583689）、ATP合酶b亚基基因（atpD）（MK607456）、DNA解旋酶基因（gyrB）（MK607457）、重组酶基因（recA）（MK607458）、RNA聚合酶b亚基基因（rpoB）（MK607459）、色氨酸合成酶b亚基基因（trpB）（MK607460），用于链霉菌种间的鉴定。对这些基因序列进行串联后，提交至NCBI中的GenBank数据库进行BLAST分析比对。利用MEGA 6.0对16S rDNA和5个不同基因（atpD，gyrB，recA，rpoB，trpB）串联序列进行多重序列比对分析，通过Neighbor-Joining法构建系统发育树。