《表4 ASPV-NM与17个已发表的ASPV分离物之间的一致性百分数》

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《苹果茎痘病毒内蒙古分离物基因组序列和生物学特征研究》

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同一个片段3个克隆测序结果一致，基于获得的6个基因组片段和5′与3′RACE片段彼此间存在至少100 nt的重叠区，通过Vector NTI 11.5软件的ContigExpress Project下面的Assemble功能组装获得ASPV-NM的全长基因组序列，长度为9 286 nt，登录号MK239268。该基因组编码5个开放阅读框，分别为RdRp（61～6 612 nt，ORF1），TGB1（6 719～7 390 nt，ORF2）；TGB2（7 392～7754 nt，ORF3）；TGB3（7 663～7 890 nt，ORF4）和CP(7 964～9 154 nt，ORF5），5′与3′端非编码区域长度分别为132 nt和60 nt。分别分析了ASPV-NM分离物与NCBI中公布的17个ASPV分离物全基因组核酸序列，5′UTR、3′UTR、RdRp、TGB1、TGB2、TGB3、CP的核酸一致性和氨基酸一致性（表4）。