《表2 本研究所用的18个ASPV全基因组序列》

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《苹果茎痘病毒内蒙古分离物基因组序列和生物学特征研究》

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使用Vector NTI 11.5(Thermo Fisher Scientific，USA）软件对测序结果进行组装。除了ASPV-NM，在NCBI中已经有17个已经公布的ASPV全基因组序列（表2），使用SDT软件的MUSCLE序列比对程序（Edgar，2004）将ASPV-NM基因组序列与17个ASPV参考基因组序列进行两两比对。采用MEGA 6.0软件（Tamura et al.，2013）分别构建基于全长基因组序列、全长RdRp基因和全长CP基因的系统发育进化树，沙地葡萄茎痘病毒（Grapevine rupestris stem pitting virus，GRSPaV）全长基因组序列作为外参（JX559646）。建树方法采用比邻法，自展重复值设置为1 000。