《表1 本研究中系统发育分析用到的序列》

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《福建枫香炭疽病病原的种类鉴定》

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注：“√”代表本研究中获得的序列。

在BioEdit[13]中对获得的序列进行修正，将修正过的序列放入NCBI(https://blast.ncbi.nlm.nih.gov/Blast.cgi）中进行BLAST，得到初步的比对结果。根据已发表的文献，从NCBI中选取42个炭疽菌种的序列作为参考序列，加上本研究中获得的6个菌株的序列（表1），一起用于系统发育分析。用PhyloSuite[14]进行单基因序列的比对及多基因序列串联在一起后，分别使用IQ-tree[15]进行最大似然（maximum likelihood，ML）分析及使用MrBayes[16]进行贝叶斯（Bayesian inference，BI）分析，并将获得的不同系统发育树进行拓扑结构比较。最后用Figtree(https://www.softpedia.com/get/Science-CAD/FigTree-AR.shtml）对系统发育树进行注释。