《表1 UCP2基因引物序列、退火温度及片段长度》

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《江口萝卜猪UCP2基因多态性与基因表达量及肉品质的相关性研究》


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参考NCBI上猪UCP2基因DNA参考序列(GenBank登录号:NC_010451.4)和mRNA参考序列(GenBank登录号:NM_214289.1)以及猪内参基因β-actin,设计5对引物用于扩增UCP2基因全部7个外显子,另外设计1对qPCR引物用于检测基因表达量,并送由上海生工生物工程有限公司合成。引物扩增片段长度及最适退火温度见表1。PCR反应体系(20μL):2×Taq PCR Master Mix 10μL,DNA模板2μL,上、下游引物(10 pmol/μL)各2μL、dd H2O 4μL。PCR反应程序:95℃预变性5 min,95℃变性30 s,退火30 s,72℃延伸30 s,35个循环后再72℃终止延伸10 min。PCR产物用1%的琼脂糖凝胶电泳检查扩增效果。荧光定量PCR反应体系(10μL):2×iTaq Universal SYBR Green Supermix 5μL,上、下游引物各0.5μL,cDNA模板1μL(将逆转录得到的cDNA稀释10倍),无RNA酶去离子水3μL。反应程序:95℃预变性3 min;95℃变性5 s,60.5℃退火30 s,72℃延伸30 s,共40个循环;延伸完成后采集荧光信号。循环结束后进行熔解曲线分析:95℃10 s,60℃15 s,然后以每5 s上升0.5℃的速率从60℃升高到95℃,每个样品做3个重复。