《表4 特异性基因Primer-BLAST结果》

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《长双歧杆菌婴儿亚种的快速区分》

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注:表中数字为引物扩增出的菌株数占该亚种菌株总数的比例；“-”表示引物未扩增出该亚种菌株。

为了解析不同基因扩增效果的差异，进一步利用Primer-BLAST（https://www.ncbi.nlm.nih.gov/tools/primer-blast/）来分析引物的特异性（表4）。结果显示，MarR和Ter B的引物只能扩增出长双歧杆菌长亚种菌株，但扩增出的菌株数较少，说明基因的特异性过强，可能不能广泛区分长亚种；Sugar kinase和长亚种Tuf基因的引物可扩增出长双歧杆菌长亚种和猪亚种，也就解释了这两个基因均无法实现长亚种和猪亚种的区分的原因，且长亚种Tuf基因可扩增出多个不同大小的片段；基因Glyoxalase和基因ABC PrimerBLAST只能扩增出部分长双歧杆菌婴儿亚种，基因的特异性较强，不能广泛用于区分婴儿亚种；Sialidase基因可扩增出全部长双歧杆菌婴儿亚种，基因的特异性较好；婴儿亚种Tuf基因可扩增出全部长双歧杆菌婴儿亚种，但可扩增出多个不同大小的片段；基因Serine Primer-BLAST只能扩增出部分长双歧杆菌猪亚种，无法实现猪亚种的区分。