《表4 A.monticola A、B亚基因组特异性重复基元类型》
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《四倍体野生种花生A.monticola全基因组SSR的开发与特征分析》
A.monticola全基因组重复基元非常丰富,从A.monticola基因组中鉴定出395个不同的重复基元(SSR motifs)。其中,在A.monticola基因组中,单核苷酸有2种,二核苷酸有4种,三核苷酸有10种,四、五、六核苷酸分别有28、93和258种;A.monticola的A基因组共鉴定出342种不同的重复基元,B基因组共搜索到356种不同的重复基元,其中,A、B亚基因组单核苷酸、二核苷酸、三核苷酸重复基元类型数目相同,分别为2、4和10种;四、五、六核苷酸分别存在特异的重复基元类型(表4)。四核苷酸重复基元类型:A基因组26种,特异性重复基元3种;B基因组25种,特异性重复基元2种。五核苷酸重复基元类型:A基因组81种,特异性重复基元6种;B基因组85种,特异性重复基元10种。六核苷酸重复基元:A基因组219种,特异性重复基元25种;B基因组230种,特异性重复基元36种。A/T是最丰富的重复基元,占基因组SSR的45.36%,其次是AT/AT、AAT/ATT、AG/CT、AAG/CTT和AC/GT,分别占基因组的19.26%、8.81%、8.71%、3.91%和2.41%。A.monticola全基因组数量最多的20种SSR的重复基元如图2所示。
图表编号 | XD0085709400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.08.01 |
作者 | 王玉龙、黄冰艳、王思雨、杜培、齐飞艳、房元瑾、孙子淇、郑峥、董文召、张新友 |
绘制单位 | 河南科技大学农学院、河南省农业科学院经济作物研究所、农业部黄淮海油料作物重点实验室、河南省油料作物遗传改良重点实验室、河南省农业科学院经济作物研究所、农业部黄淮海油料作物重点实验室、河南省油料作物遗传改良重点实验室、河南省农业科学院经济作物研究所、农业部黄淮海油料作物重点实验室、河南省油料作物遗传改良重点实验室、郑州大学生命科学学院、河南省农业科学院经济作物研究所、农业部黄淮海油料作物重点实验室、河南省油料作物遗传改良重点实验室、河南省农业科学院经济作物研究所、农业部黄淮海油料作物重点实验室、河南省油料作 |
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