《表1 用于杭白菊叶枯病病原菌分子鉴定的引物》

《表1 用于杭白菊叶枯病病原菌分子鉴定的引物》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《杭白菊叶枯病病原菌鉴定及其对多菌灵的抗性机制》


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从1.2.1分离保存的菌株中随机选择YK-YJQ-10、YK-YY-1、YK-LZ-9、YK-LZ-10、YK-LJQ-3和YK-LJQ-4菌株进行分子鉴定。将纯化后的菌株分别在PDA平板上25℃下黑暗培养7 d后,刮取菌丝,按照真菌基因组DNA快速抽提试剂盒说明书提取病原菌基因组DNA。分别设计扩增核糖体内转录间隔区(internal transcribed spacer,ITS)、nrDNA大亚基(large subunit,LSU)和β-微管蛋白基因(β2-tubulin,TUB2)的通用引物(表1),所用引物均由生工生物工程(上海)股份有限公司合成。50μL PCR扩增体系:10μmol/L上下游引物各2μL、病原菌DNA1μL、2×Taq PCR Master Mix 25μL,ddH2O补足至50μL。LSU的扩增程序:95℃预变性2 min;95℃变性30 s,50℃退火30 s,72℃延伸40 s,35个循环;72℃延伸10 min。ITS和TUB2的PCR退火温度分别为55℃和53℃,其余步骤同LSU(张佳星等,2018)。利用测序所得TIS、LSU和TUB2基因序列进行联合系统发育分析(Pearce et al.,2016)。将本试验所得菌株及从GenBank下载获得的参比菌株各基因序列使用MAFF 7.037b软件进行多重比较,采用GBLOCKS 0.91b软件进行保守区域选择,应用SequenceMatrix 1.7.8软件将各基因串联成数据集,并用Mega 5.0软件以邻接法(neighbor joining,NJ)构建系统发育树,重复1 000次(Chen et al.,2015)。