《表1 裂皮鹅膏MSDIN基因家族编码的前体肽》
注:MSDIN-L:已报道MSDIN家族未知功能的多肽序列;UnPro:未报道的多肽序列
本研究在裂皮鹅膏转录组CDS高级功能注释中检索毒肽及其相关肽类(MSDIN家族)基因家族共获得了38个与MSDIN家族相关的Unigene,用NCBI的ORF finder软件检索Unigene序列的编码框并进行翻译获得了26条不同核心序列的多肽,经反转录扩增验证,确定为24条MSDIN基因家族的序列(表1)。功能注释结果显示,裂皮鹅膏MSDIN基因家族除编码α-鹅膏毒肽(α-amanitin)、β-鹅膏毒肽(β-amanitin)和羧基二羟鬼笔毒肽(Phallacidin)等3种鹅膏毒素外,还编码了21个未知功能的肽类,其中16个肽类物质为首次报道,其核心序列分别为AWDSKHP(七肽)、FLFPVIPP(八肽)、FYFYLGIP(八肽)、HFYNLMPP(八肽)、ILKKPWAP(八肽)、LGRPT-HLP(八肽)、NHGHRTIP(八肽)、SYGYRAFP(八肽)、IFLIMFIPP(九肽)、ILFIQLEIP(九肽)、LLLIFLLTP(九肽)、IFIAFPIPP(九肽)、LLIPGLSLPP(十肽)、LVFIPPY-FAP(十肽)、FIPLGIITILP(十一肽)及FFLIIVKPCGNP(十二肽)。
图表编号 | XD0062455400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.06.25 |
作者 | 贺勇、张成花、邓旺秋、李泰辉、周小云 |
绘制单位 | 湖南农业大学生物科学技术学院、广东省科学院广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室、广东省科学院广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室、湖南农业大学生物科学技术学院、广东省科学院广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室、广东省科学院广东省微生物研究所华南应用微生物国家重点实验室广东省菌种保藏与应用重点实验室、湖南农业大学生物科学技术学院 |
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