《表3 来源于GeneBank和文献的MSDIN前体肽序列信息》

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《剧毒裂皮鹅膏转录组测序与毒肽相关基因家族分析》


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本研究中用于MSDIN家族聚类分析的前体多肽序列一共有42条,其中包含14条从NCBI数据库检索得到的前体多肽序列,4条来源于毒鹅膏基因组分析数据的前体肽序列(Pulman et al.,2016),以及24条从裂皮鹅膏转录组数据中检索并经反转录验证后获得的MSDIN多肽序列(表1;表3)。所有序列使用ClustalW进行比对后,对需要调整的序列进行手工调整,然后利用MEGA 6.0(Tamura et al.,2013)采用最大似然法(ML)进行建树分析,Bootshrap设置为1 000,利用MEGA中提供的替代模型测试选择Jones-Taylor-Thornton作为本次建树的最佳进化模型,位点之间采用Gamma分布,含有Gaps或缺失数据高于5%的位点则选择部分删除(位点覆盖截止为95%),进化树上只显示高于50%的支持率。