《表1 藜麦cqu-mi RNAs的前体分析》

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《藜麦miRNA及其调控靶基因的全基因组预测与分析》


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从mi RBase数据库下载已知植物的mi RNAs共计38 589条,经去冗余后得到34 672条mi RNAs序列,以去冗余后的mi RNAs前体序列为探针与藜麦基因组序列进行BLAST比对分析,筛选获得40条候选mi RNAs前体序列,其中能用Mfold软件折叠形成稳定茎环结构且符合相应筛选标准的共8条(表1,图1)。这8条藜麦cqu-mi RNAs分别属于4个mi RNAs家族(表2),其中mi R171家族有4个成员,分别为cqu-mi R171a、cqu-mi R171b、cqumi R171c和cqu-mi R171d;其次为mi R156家族,有2个成员,分别为cqu-mi R156a、cqu-mi R156b;而mi R157、mi R166家族都各只有1个成员。