《表2 ESCC组织中表达上调和下调倍数较大的前10个circ RNAs》
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《食管鳞状细胞癌差异性表达circRNA的初步筛选和分析》
设置如下筛选标准:当6个组织样本的明细分析有生物学重复时,使用padj<0.05来筛选circ RNAs;当6个组织样本无生物学重复时,使用qvalue<0.01和log2FC>1来筛选。当使用以上标准筛选测序数据时,共发现905个差异表达的circ RNAs,其中表达上调的有404个、表达的下调有501个。这些差异表达的circ RNAs大部分来自于外显子的剪接,其中前10位表达上调的circ RNAs及前10位表达下调的circ RNAs见表2。其中hsa_circ_0004390是上调circ RNAs中表达倍数最大的(FC=7.9712),novel_circ_0012687是下调circ RNAs中表达倍数最大的(FC=5.8796)。
图表编号 | XD00229187900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.25 |
作者 | 张德海、付正、王健、王国君、黄军贤、陈熹 |
绘制单位 | 江苏大学附属金坛医院胸外科、南京大学生命科学学院、江苏大学附属金坛医院胸外科、江苏大学附属金坛医院胸外科、江苏大学附属金坛医院胸外科、南京大学生命科学学院 |
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