《表2 20个Hub基因涉及的生物学功能及其在ESCC组织中表达的验证Tab.2 The biological functions of 20 Hub genes and the verificati

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《基于生物信息学分析的食管鳞状细胞癌关键枢纽基因的筛选及验证》

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将筛选获得的223个巨大差异基因输入STRING网站，构建PPI网络（图1），并进一步应用Cytoscape软件中的MCODE分析对PPI网络中连接最为紧密的基因进行分组，形成多个模块。结果显示共有6个有意义的模块从PPI网络中被划分了出来（表1），前3个模块评分较高（图2）。其中评分最高的模块1中共包含了ECT2、KIF2C、NEK2、TTK等20个基因，共形成了190种相互作用关系，具有较高连接度，为Hub基因。GSE100942芯片数据分析结果（表2）显示，这20个Hub基因在食管癌组织中均表达上调。除这6个模块外，其他基因间的相互作用比较分散。