《表1 223个DEGs构成的PPI网络中连接度较高的6个模块及其包含的基因Tab.1 The six modules with high connection degree and their ge
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《基于生物信息学分析的食管鳞状细胞癌关键枢纽基因的筛选及验证》
将筛选获得的223个巨大差异基因输入STRING网站,构建PPI网络(图1),并进一步应用Cytoscape软件中的MCODE分析对PPI网络中连接最为紧密的基因进行分组,形成多个模块。结果显示共有6个有意义的模块从PPI网络中被划分了出来(表1),前3个模块评分较高(图2)。其中评分最高的模块1中共包含了ECT2、KIF2C、NEK2、TTK等20个基因,共形成了190种相互作用关系,具有较高连接度,为Hub基因。GSE100942芯片数据分析结果(表2)显示,这20个Hub基因在食管癌组织中均表达上调。除这6个模块外,其他基因间的相互作用比较分散。
图表编号 | XD0048416100 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.25 |
作者 | 郭艳丽、梁晓亮、邝钢、吴璇、康小亮、董稚明、沈素朋、梁佳、郭炜 |
绘制单位 | 河北医科大学第四医院河北省肿瘤研究所病理学研究室、河北医科大学第四医院河北省肿瘤研究所病理学研究室、河北医科大学第四医院河北省肿瘤研究所病理学研究室、河北医科大学第四医院河北省肿瘤研究所病理学研究室、河北医科大学第四医院河北省肿瘤研究所病理学研究室、河北医科大学第四医院河北省肿瘤研究所病理学研究室、河北医科大学第四医院河北省肿瘤研究所病理学研究室、河北医科大学第四医院河北省肿瘤研究所病理学研究室、河北医科大学第四医院河北省肿瘤研究所病理学研究室 |
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