《表2 ssc-miR-339-3p的前体信息》

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《猪miR-339-3p靶基因预测分析及部分靶基因验证》

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ssc-miR-339在进化剪接过程中存在2条前体（表2），结合miRBase数据库对比发现，ssc-miR-339-3p是由ssc-miR-339-1前体序列剪接形成的成熟体。因此，本研究使用在线程序对ssc-miR-339-1前体的上游2 000 bp区域进行转录因子结合位点预测，发现在其启动子区域有转录因子Sp1（Sp1transcription factor）、原癌基因JUN（JUN proto-oncogene，JUN或AP-1）、增强子激活结合蛋白2（activating enhancer binding protein 2 alpha，AP-2）、CCAAT增强子结合蛋白α（CCAAT enhancer binding proteinα，C/EBPα）、肝细胞核因子1（hepatocyte nuclear factor 1-alpha，HNF-1）、核转录因子κB（nuclear factorκB，NF-κB）、上游刺激因子（upstream stimulatory factor，USF）、血清反应因子（serum response factor，SRF）、转录因子Oct-1（octamer transcription factor1，Oct-1）等多个转录因子结合位点，其中Sp1、AP-2、C/EBPα、NF-κB、USF和SRF参与了肠上皮细胞的增殖分化及介导的免疫炎症反应。