《表4 ssc-miR-339-3p的靶基因统计》

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《猪miR-339-3p靶基因预测分析及部分靶基因验证》


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选择RNAhybrid、PITA和miRanda 3种预测软件预测ssc-miR-339-3p的靶基因,分别得到2 837、1 957和1 207个靶基因,取3者交集共得到114个基因(图1),合并miRTarBase数据库中已知的18个miR-339-3p靶标和文献报道的29个miR-339-3p(5p)靶基因,去掉1个重复,一共获得160个靶基因作为后续GO注释条目和KEGG Pathway富集分析的靶基因集合(表4)。