《表2 柑橘中miRNA及其验证的靶基因》

  提示：宽带有限、当前游客访问压缩模式

本系列图表出处文件名：随高清版一同展现

《microRNA参与柑橘生长发育和抗逆的研究进展》

1. 获取 高清版本忘记账户？点击这里登录

1. 下载图表忘记账户？点击这里登录

miRNA的功能与其靶基因的功能息息相关，因此对靶基因的预测和验证非常必要（表2）。靶基因的预测常利用生物信息学的方法。目前已开发出多个植物miRNA靶基因预测的算法，如psRNAtarget（Dai et al.，2018）、WMD3(Schwab et al.，2006）和ViennaRNA(Lorenz et al.，2011）等在线软件。利用生物信息学软件对靶基因进行预测时遵循以下规则（Allen et al.，2005；Schwab et al.，2005）——（1）miRNA和候选靶基因间不配对碱基不超过4个（G-U算0.5个不配对）；（2)miRNA与靶基因的靶定区不能有多于2处相邻位点的错配，且在miRNA5′端第2～12碱基位点不得有相邻错配位点；（3）第1～12位点不允许超过2.5个错配，第10～11碱基位点不能出现错配；（4)miRNA和靶基因复合体最小自由能要≥miRNA与其最佳互补序列结合时自由能的72%。