《表4 通过DAVID数据库预测miRNA-340下游的靶基因参与的信号通路》
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《胃癌中miRNA-340的体内外增殖能力检测及生物信息分析》
由于miRNA通过下游靶基因参与肿瘤的增殖、侵袭和转移。因此,本研究通过targetscan在线预测miRNA-340的下游靶基因;通过DAVID数据库对miRNA-340下游靶基因进行聚类分析,预测相关靶基因可能参与的信号通路。结果显示,miRNA-340下游预测的靶基因中,共预测出1391个靶基因,其中有3个及以上的保守结合部位的靶基因有21个(表2),其中多个靶基因均参与肿瘤的发生及侵袭相关的基因。例如,与细胞粘附相关的原癌基因CDON,激动蛋白相关的MYO9A等基因(表3)。在1391个靶基因中,选取其中有2个及以上保守结合位点的186个靶基因进行KEGG通路分析,结果显示,186个靶基因参与吗miRNA在肿瘤的发生机制,Wnt通路的激活及多种肿瘤相关的通路(表4)。
图表编号 | XD0057062300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.20 |
作者 | 王健、陈文静、林慧娟、张江宇 |
绘制单位 | 广州医科大学附属广东省妇儿医院病理科、广州医科大学附属广东省妇儿医院病理科、广州医科大学附属广东省妇儿医院病理科、广州医科大学附属广东省妇儿医院病理科 |
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