《表6 10个新预测miRNA的靶基因功能注释》

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《向日葵锈病抗性相关microRNA的挖掘及其靶基因预测》

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10个新预测的miRNA共预测到117个靶基因，每个miRNA均对应多个靶基因，其中一小部分靶基因功能未知，有86个靶基因获得其功能注释（表6），如含有NAC结构域的蛋白、富含组氨酸的钙结合蛋白、G型凝集素丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶LECRK1、丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶RPK2、toll/白细胞介素-1受体样蛋白、ATP依赖性DNA解旋酶RRM3等。如Han-miR43的靶基因预测为抗病相关RPP13类似蛋白1，RPP13基因的富亮氨酸重复区域具有很高的多态性，已有报道该基因参与拟南芥抗霜霉病（Peronospora parasitica）反应过程[31]；Han-miR11的靶基因预测为G型凝集素S受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶LECRK1。植物凝集素受体激酶被认为在发育过程中以及对各种胁迫的适应性反应中起着至关重要的作用，LECRK1在先天免疫信号传导中起作用，如在病原体感染后在植物细胞表面发挥信号传导作用[32]；Han-miR42的靶基因预测为LRR受体样丝氨酸/苏氨酸蛋白激酶RPK2，该基因控制拟南芥花药发育[33]；Han-miR21的靶基因注释为类似病程相关蛋白STH-2，STH-2基因在细胞质中起作用，将病程相关蛋白STH-2基因转入马铃薯中，并用X病毒感染转基因马铃薯，观察到转基因的马铃薯对病原菌并不表现出抗性，推测此蛋白在植物防御系统中可能不起主导作用[34]。Han-miR67的靶基因预测为类似TMV抗性蛋白N，Han-miR21的靶基因类似抗病蛋白At3g14460，这两个基因[35]在葡萄（Vitis vinifera）的两个品种‘Kyoho’和‘Fengzao’中差异表达显著，‘Fengzao’是‘Kyoho’的芽变种，比‘Kyoho’早成熟30天，这两个抗病相关基因可能参与促进葡萄‘Fengzao’品种的早熟。综上我们发现其中有部分靶基因的功能与已知的参与病程相关的基因功能类似，由此得知预测得到的新miRNA很可能参与向日葵受到锈菌侵染的防御反应过程，这些新预测的miRNA可能在向日葵抗病相关过程中发挥作用。