《表5 10个新预测miRNA的同源性分析》

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《向日葵锈病抗性相关microRNA的挖掘及其靶基因预测》

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通过miRBase（http://mirbase.org/）数据库，对10个新预测miRNA进行同源性分析（表5），分析结果发现，Han-miR67与苜蓿mtr-miR156b-3p的相似性指数高达100%，与水稻osa-miR156b-3p的相似性指数为96%。mtr-miR156b靶向SBP/SPL家族转录因子，在苜蓿的发育和应激反应中，有较高的表达[29]；osa-miR156b在水稻生长发育过程和水稻病毒致病过程中发挥作用[30]，在过量表达miR156b的转基因水稻植株中，miR156b的靶基因SPL（Squamosa promoter-binding-like）家族成员的表达量受到不同程度的影响，同时水稻体内其它一些miRNA的表达量也受到影响。通过分析我们发现，向日葵新预测的这10个miRNA分别与拟南芥、烟草、水稻、高粱、苜蓿、大豆等作物中起调节作用的miRNA有相似性，而且其相似指数均较高，说明向日葵新预测miRNA与以上这些作物同源。根据以上分析推测向日葵新预测的miRNA中Han-miR42与HanmiR67可能是参与病害逆境胁迫响应的基因，当然，这一推测还需要通过大量的实验进一步验证。