《表2 PDB中预测的各亚基同源性比较》

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《嗜碱盐单胞菌X3中异化型硝酸盐还原酶编码基因簇的功能验证及蛋白结构预测》

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结合图6和表2分析NarGYJV的蛋白3D结构预测，Phyre2预测的NarG、NarY和NarV蛋白3D结构（见图6 （a）、（b）、（c）） ，在PDB中同源关系最近的是1Q16，来自大肠杆菌三亚基与1Q16之间均具有6%～100%的覆盖率，54%～74%的一致性，各对应区域如图6（d）所示；图6（e）是NarJ的蛋白3D结构预测图，在PDB中预测的唯一同源性3D结构来自家牛（Bos Taurus）的蛋白细胞色素B5（Cytochrome B5）（见图6（f）） ，但其覆盖率仅13%，相似性仅44%（见表2），可能因为PDB库中相应蛋白质数据不全导致比对结果不理想。