《表3 同源性分析的菌株鉴定结果》

《表3 同源性分析的菌株鉴定结果》   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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Biotyper的MSP聚类分析结果显示,同一抽样地域菌株间的蛋白质图谱差异性水平小于不同抽样地域菌株间的差异(见图3-a)。在NCBI上比对分析不同菌株基因序列,16S r RNA基因序列比对得到同属Burkholderia的3个不同种;rec A基因序列比对得到10个菌株为Burkholderia cepacia,1个菌株为Burkholderia contaminans(见表3)。选取同属Burkholderia的标准菌株16s r RNA基因序列和rec A基因序列,使用MEGA 6.0软件构建系统进化树。通过系统发育树分析发现,它们在16s r RNA基因序列上进化程度非常相近,很难区分不同抽样地域间菌株的亲缘关系(见图3-b);在rec A基因序列上,能够有效区分不同抽样地域间菌株的亲缘关系,并呈现抽样地域的相近性(见图3-c)。综合以上结果,说明各菌株间的亲缘关系与抽样地域呈相关性。在分类水平上,洋葱伯克霍尔德菌群的rec A基因序列差异性大于16S r RNA基因序列。来源3个不同抽样地域的未开封样品菌株(WBH、WNN、WLZ)、生产企业纯化水中检出的菌株(NQC)以及与生产企业同一地域的抽检样品菌株(NNH、NNY)之间,在rec A基因水平上具有较近的亲缘关系。