《表3 吐絮期序列鉴定和同源性分析结果》
根据AM真菌DGGE指纹图谱(图3)选择DGGE胶上易于区分的条带进行克隆测序。在花铃期样品中选取24条条带,在吐絮期样品中选取27条条带,分别进行测序。测序结果登陆美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI),得到条带所代表的AM真菌类型。分析所得序列的归属(表2、表3)以及样品的指纹图谱(图3)发现,花铃期测序的样品条带中两组对照TH2和013011(抗旱)、石远321和SGK321(抗虫)多为共有条带,均包含有Uncultured Glomus(球囊霉属)、Uncultured Glomeraceae(球囊霉科)、Uncultured Glomeromycota(球囊菌门)、Uncultured Rhizophagus(根孢囊霉属)和Glomus sp.,且亮度较高的条带大多为Uncultured Glomus(球囊霉属),因此Uncultured Glomus(球囊霉属)为共同优势属。对比TH2和013011(抗旱)样品指纹图谱(图3)发现条带18和条带24为转基因棉013011(抗旱)特有条带,分别属于Uncultured Glomus(球囊霉属)和Uncultured Glomeromycota clone(球囊霉科);条带13为非转基因棉TH2特有条带,属于Uncultured Rhizophagus(根孢囊霉属)。对比石远321和SGK321(抗虫)样品指纹图谱(图3)发现条带13为转基因棉SGK321特有条带,属于Uncultured Rhizophagus(根孢囊霉属);条带24为非转基因棉石远321特有条带,属于Uncultured Glomeromycota(球囊菌门)。未能在GenBank收录相似的AM真菌分类中找到与条带17相似的分类。吐絮期测序的样品条带中两组对照TH2和013011(抗旱)、石远321和SGK321(抗虫)多为共有条带,均包含有Uncultured Rhizophagus(根孢囊霉属)、Uncultured Glomeraceae(球囊霉科)、Uncultured Glomus(球囊霉属)、Rhizophagus sp.、Uncultured Diversispora(多孢囊霉属)、Uncultured Glomeromycotina和Uncultured Claroideoglomus(幼套近明囊属),且亮度较高的条带大多为Uncultured Clomus(球囊霉属),因此Uncultured Clomus(球囊霉属)为共同优势属。对比TH2和013011(抗旱)样品指纹图谱(图3)发现条带18为非转基因棉TH2特有条带,属于Uncultured Glomus(球囊霉属),条带15为转基因棉013011特有条带,属于Rhizophagus sp.(根孢囊霉属)。对比石远321和SGK321(抗虫)样品指纹图谱(图3)发现全为共有条带。未能在GenBank收录相似的AM真菌分类中找到与条带16、20、21、23、24相似的分类。
图表编号 | XD0038302300 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.02.20 |
作者 | 刘瑞华、陈静怡、王丽丽、李静、刘惠芬、杨殿林、赵建宁 |
绘制单位 | 天津农学院农学与资源环境学院、农业农村部环境保护科研监测所、农业部产地环境污染防控重点实验室、天津市农业环境与农产品安全重点实验室、天津农学院农学与资源环境学院、农业农村部环境保护科研监测所、农业部产地环境污染防控重点实验室、天津市农业环境与农产品安全重点实验室、农业农村部环境保护科研监测所、农业部产地环境污染防控重点实验室、天津市农业环境与农产品安全重点实验室、农业农村部环境保护科研监测所、东北农业大学资源与环境学院、农业部产地环境污染防控重点实验室、天津市农业环境与农产品安全重点实验室、天津农学院农学 |
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