《表2 菌种鉴定和Blast-n同源性分析结果》
对测序所得序列,根据测序图谱峰型截取合适长度后,利用NCBI数据库的Blast-n程序对其进行16S rDNA序列分析以确定菌株的种属关系。通过结合细菌形态特征和利用NCBI数据库的Blast-n程序对测序获得的部分长度16S rDNA序列(821 bp)进行了同源性分析(表2),结果表明菌株X2(3)与Paenibacillus最同源,同源性达到99%,推测其为类芽孢杆菌属(Paenibacillus)的一个种。菌株X6-1与Sphingobacterium daejeonense最同源,同源性达到100%,推测其为鞘氨醇杆菌属(Sphingobacterium)的一个种。菌株X4(1)与Microbacterium最同源,同源性达到99%,推测其为微杆菌属(Microbacterium)的一个种。菌株X3-1与Pseudomonas最同源,同源性达到98%,推测其为假单胞菌属(Pseudomonas)的一个种。菌株X7-1经分析为Uncultured bacterium clone,在Blast-n分析中未找到同源菌。
图表编号 | XD00170536800 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.06.05 |
作者 | 孟建宇、丁雪敏 |
绘制单位 | 内蒙古农业大学生命科学学院应用与环境微生物研究室、内蒙古农业大学生命科学学院应用与环境微生物研究室 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |