《表2 20种氨基酸的分类》

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《基于机器学习方法的非编码RNA-蛋白质相互作用的预测》

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注:1.极性大小:-，极性<1.0；+，1.0<极性<2.0；++，2.0<极性<3.0；+++，极性>3.0；+’+’+’，极性>3.0且方向相反。2.侧链体积（链）:-，体积<50；+，体积>50。3.半胱氨酸从第3类分离出来，是因为它能形成二硫键。

在特征提取阶段，分别提取ncRNA和蛋白质的序列特征，ncRNA统计每条核苷酸链的四联体频率，因为有4种核苷酸（AUGC），所以得到4×4×4×4=256维大小的向量。对于蛋白质，首先根据氨基酸的理化性质，将20种氨基酸分成7类（表2），然后基于7大类氨基酸统计每条氨基酸序列三联体的频率，最后得到7×7×7=343维大小的特征向量。