《表1 病毒RT-PCR检测引物Tab.1 Primers for RT-PCR virus detection》

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《番茄斑驳花叶病毒海南分离物全基因组序列分析》


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分别合成(上海生工生物工程有限公司)番茄斑驳花叶病毒(ToMMV)[10]、烟草花叶病毒(TMV)[12]和番茄花叶病毒(ToMV)[13]的特异性引物(表1),采用RT-PCR检测对小RNA测序结果进行验证。采用Trizol试剂(南京诺唯赞生物科技有限公司)提取番茄(圣女果)感病植株幼嫩叶片的总RNA,以其为模板利用一步法反转录试剂盒HScript?One Step RT-PCR Kit Ver.5.1(南京诺唯赞生物科技有限公司)进行RT-PCR扩增。反应体系为:5.0μL 2×One Step Mix,2.5μL RNase free ddH2O,0.5μL CPF(10μmol/L),0.5μL CPR(10μmol/L),1.0μL模板RNA,0.5μL One Step Enzyme Mix,加ddH2O至总反应体积20μL。RT-PCR反应条件为:50℃反转录30 min,94℃预变性3 min;94℃变性30 s,55℃退火30 s,72℃延伸1 min,35个循环。对5株田间样品进行检测,根据扩增产物的大小和产物直接测序结果鉴定样品中的病毒种类。