《表1 外显子区域中不同类型SNP数目》
SNP、InDel和CNV检测结果见表1~3。对检测到的SNP和INDEL进行如下过滤:去除人群数据库中突变频率过高(AF>0.05)的变异,去除ClinVar数据库注释为良性或疑似良性的变异,去除突变碱基深度过低(AO<5)的变异,去除位于内含子和基因间区的变异,去除同义突变,去除本地外显子数据库中突变频率过高(AF>0.05)的变异。对所有共有突变进行脑瘫相关基因的筛选,主要与Genetics Home Reference数据库比对,共检索到与两例相关的30个基因(表4)。共有7个基因(CD59、FOLR1、KANK1、MEF2C、PRKCH、ROBO3、SLC25A12)为两例患儿共有突变(表5)。在7个基因中,只在KANK1的外显子区域发现了一个两例共有的突变:NM_153186:c.1517C>T,是错义突变。经数据库检索及分析,我们认为该突变致病的可能性相对较小,属于临床意义不明的变异位点。
图表编号 | XD0027060400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.11.20 |
作者 | 朱庆文、周翔、倪玉飞、王婧、印洪刚、张勤、卞文君、张玲莉、林孟思、刘江悦、周君、沙春秀 |
绘制单位 | 南通市妇幼保健院(南通大学附属妇幼保健院)产前诊断中心、南通市妇幼保健院(南通大学附属妇幼保健院)产前诊断中心、南通市妇幼保健院(南通大学附属妇幼保健院)产前诊断中心、南通市妇幼保健院(南通大学附属妇幼保健院)产前诊断中心、南通市妇幼保健院(南通大学附属妇幼保健院)产前诊断中心、南通市妇幼保健院(南通大学附属妇幼保健院)产前诊断中心、南通市妇幼保健院(南通大学附属妇幼保健院)产前诊断中心、南通市妇幼保健院(南通大学附属妇幼保健院)产前诊断中心、南通市妇幼保健院(南通大学附属妇幼保健院)产前诊断中心、南通市 |
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