《表1 同源模建结果:虚拟筛选竞争性抑制NDRG3与L-Lactate结合的小分子研究》
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《虚拟筛选竞争性抑制NDRG3与L-Lactate结合的小分子研究》
本文共构建10个NDRG3蛋白模型(表1),根据PDF总能量和DOPE评分选择2个参数均最小的4号模型进行Loop优化和能量最小化过程.拉氏图(图2A)显示:优化后的模型含有12个不合理氨基酸残基,占氨基酸总数的4.2%.Profiles-3D法评估优化后的模型,验证分数为125.6(最高期望值:131.009;最低期望值:58.954).验证分数应高于最低期望值,且与最高期望值越接近的模型越可靠.在Profiles-3D法评估后(图2B)根据验证分数着色,蓝色、白色、红色分别对应高分区、平均分区和低分区,色带越细,结构越好.综合2种评估方法,说明优化后4号模型的结构非常合理.
图表编号 | XD0026778500 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.06.25 |
作者 | 曹洪玉、吴艳华、周兴智、郑学仿、蒋革 |
绘制单位 | 大连大学生命科学与技术学院、大连大学生命科学与技术学院、大连大学生命科学与技术学院、大连大学生命科学与技术学院、大连大学生命科学与技术学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |