《表2 计算机筛选获得的小分子化合物》
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《基于转酮醇酶为靶标的除草活性分子筛选及其除草活性评价》
综合考虑类农药性质[14](即分子量(molecular weight,MW)≤435 Da,脂水分配系数(calculated octanol-water partition coefficient,ClogP)≤6,氢键受体数量(number of H-bond acceptors,HBA)≤6,氢键供体数(number of H-bond donors,HBD)≤2,可旋转键数量(number of rotatable bonds,ROB)≤9,芳香键的数量(number of aromatic bonds,ARB)≤17)受体与配体小分子的结合能以及通过分析受体与配体相互作用的关键氨基酸等多方面因素,筛选潜在的转酮醇酶抑制剂。最终在SPECS数据库中购买得到16个结构新颖的化合物,并作进一步的深入研究,分子对接结果及化合物基本信息如表1、表2所示。利用Pymol实现对接模型的结合模式并进行图形显示。结果显示,每一个化合物都和活性中心的氨基酸残基His 103,His 143,Leu194,Gly 234和His 340形成范德华力相互作用,并与转酮醇酶的活性中心形成稳定结合构象,其中化合物1a与转酮醇酶通过氢键结合模式最佳(见图2)。
图表编号 | XD0085074700 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2019.07.01 |
作者 | 高卫、李晓天、任达、董存涛、陈来、霍静倩、张金林 |
绘制单位 | 河北农业大学植物保护学院、河北农业大学植物保护学院、河北农业大学植物保护学院、河北农业大学植物保护学院、河北农业大学植物保护学院、河北农业大学植物保护学院、河北农业大学植物保护学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |