《表3 虚拟筛选得到的前30个化合物的Lib Dock得分Table 3 Lib Dock scores of the 30 top-ranked compounds by virtual scree

《表3 虚拟筛选得到的前30个化合物的Lib Dock得分Table 3 Lib Dock scores of the 30 top-ranked compounds by virtual scree   提示:宽带有限、当前游客访问压缩模式
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《虚拟筛选竞争性抑制NDRG3与L-Lactate结合的小分子研究》


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活性位点分析表明,位点2的得分最高,说明L-Lactate最可能在该位点与NDRG3蛋白结合,所以选择位点2作为靶标位点进行虚拟筛选.位点4从氨基酸组成上基本与位点2相似,只有少数几个氨基酸有差别,因此仅以位点2为重点计算.选择位点2作为靶标位点对InsightⅡ软件分子库中的近3 000个化合物进行虚拟筛选,可得一系列能够竞争性抑制NDRG3蛋白与L-Lactate结合的小分子,其中竞争抑制性最强的30个化合物如表3所示.Pimozide与NDRG3蛋白在靶标位点的Lib Dock得分最高(155.010),而L-Lactate与NDRG3的LibDock得分仅为54.651,说明虚拟筛选获得的这些候选化合物更可能占据NDRG3蛋白的活性位点,从而竞争性抑制L-Lactate与NDRG3蛋白的结合,阻遏NDRG3介导的低氧反应.