《表3 虚拟筛选得到的前30个化合物的Lib Dock得分Table 3 Lib Dock scores of the 30 top-ranked compounds by virtual scree
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《虚拟筛选竞争性抑制NDRG3与L-Lactate结合的小分子研究》
活性位点分析表明,位点2的得分最高,说明L-Lactate最可能在该位点与NDRG3蛋白结合,所以选择位点2作为靶标位点进行虚拟筛选.位点4从氨基酸组成上基本与位点2相似,只有少数几个氨基酸有差别,因此仅以位点2为重点计算.选择位点2作为靶标位点对InsightⅡ软件分子库中的近3 000个化合物进行虚拟筛选,可得一系列能够竞争性抑制NDRG3蛋白与L-Lactate结合的小分子,其中竞争抑制性最强的30个化合物如表3所示.Pimozide与NDRG3蛋白在靶标位点的Lib Dock得分最高(155.010),而L-Lactate与NDRG3的LibDock得分仅为54.651,说明虚拟筛选获得的这些候选化合物更可能占据NDRG3蛋白的活性位点,从而竞争性抑制L-Lactate与NDRG3蛋白的结合,阻遏NDRG3介导的低氧反应.
图表编号 | XD0026778600 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2018.06.25 |
作者 | 曹洪玉、吴艳华、周兴智、郑学仿、蒋革 |
绘制单位 | 大连大学生命科学与技术学院、大连大学生命科学与技术学院、大连大学生命科学与技术学院、大连大学生命科学与技术学院、大连大学生命科学与技术学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |