《表1 候选内参基因稳定性排名》
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《三叶青块根发育时期RT-qPCR内参基因的筛选与体系建立》
ge Norn是根据M值的大小来确定候选内参基因稳定性,M值的大小由程序计算所得,M值越小候选基因的表达就越稳定,本研究ge Norn结果显示M值排序为:β-actin>GBSS>GAPDH=RNA polymerase II,说明GAPDH和RNA polymerase II更适合作为内参基因;Norm Finder结果显示,GAPDH、GBSS、β-actin和RNA polymerase II的稳定值分别为0.57、0.79、1.21和1.55,最小值为0.521,即GAPDH,其次为GB-SS,β-actin,RNA polymerase II;Best Keeper分析软件结果分析显示,β-actin、GAPDH、RNA polymerase II和GBSS候选内参基因的SD值分别为1.07、0.47、1.37和0.76,GBSS的表达最稳定,稳定性结果依次为GBSS>GAPDH>β-actin=RNA polymerase II,GBSS表达最稳定;Delta Ct法,通过CT值计算候选内参基因的平均标准差(SD),判定内参基因稳定性,结果分析显示,β-actin、GAPDH、RNA polymerase II和GBSS的SD值分别为1.56、1.31、1.78和1.56,稳定性排名分别为GAPDH>GBSS>β-actin>RNA polymerase II,GAPDH表达最稳定(表1)。
图表编号 | XD00220571000 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.10.28 |
作者 | 袁莉霞、吴浩、彭昕、仇丹、陶忠富、邱文宇 |
绘制单位 | 浙江医药高等专科学校医药生物技术研究所、浙江医药高等专科学校医药生物技术研究所、浙江医药高等专科学校医药生物技术研究所、宁波工程学院奉化研究院、宁波工程学院奉化研究院、浙江医药高等专科学校医药生物技术研究所 |
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