《表1 预实验引物序列:山核桃MITE序列识别和MITE-PCR反应体系的建立》

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《山核桃MITE序列识别和MITE-PCR反应体系的建立》


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注:F:正向引物;R:反向引物

随机选取6个样品DNA及4对引物(表1),用Yaakov等(2012)的体系进行预实验,结果发现有扩增位点,但有弥散的背景。Yaakov等(2012)针对小麦的MITE-PCR体系退火温度为60℃,而设计引物时软件建议的山核桃退火温度在54℃~56℃。本研究将PCR反应条件中退火温度降低至55℃,其他条件均不变,结果条带清晰,没有明显的拖尾现象(图1)。故在山核桃中MITE-PCR反应体系可以延用小麦的体系,仅将退火温度改为55℃。