《表1 数据过滤统计分析:外源因子处理下蓝莓不同发育阶段果实的转录组分析》
注:1:样本(外源因子-果实发育阶段-重复);2:原始下机序列的总序列数;3:过滤后的高质量序列的总序列数;4:过滤后高质量序列数占原始下机序列数的比例(%);5:由于含N过高,被去掉的序列数占原始下机序列数的比例(%);6:在过滤前,原始序列中质量值大于30 (错误率小于0.1%)的碱基数占总
本试验使用Illumina高通量测序平台对经蒸馏水(CK)、0.6%醋酸钙、0.6%硫酸铵及1%蔗糖分别处理后的蓝莓在盛花后20 d,盛花后40 d,盛花后60 d,盛花后70 d,盛花后80 d的果实共60份样本进行测序,共制备60个c DNA文库。测序数据共得到原始下机序列的总序列(Raw reads)数为2 924 462 148条,过滤后的高质量序列的总序列(Clean reads)数为2 723 731 442条。过滤后高质量序列数占原始下机序列数的比例(Clean reads rate)平均为93.14%,过滤后总序列中质量值大于30 (错误率小于0.1%)的碱基数的比例为91.36%~93.82%,说明测序数据平均质量较好,可用于后续分析(表1)。
图表编号 | XD00194431400 严禁用于非法目的 |
---|---|
绘制时间 | 2021.02.14 |
作者 | 彭舒、袁玮、张婷渟、杨芩 |
绘制单位 | 凯里学院大健康学院、凯里学院大健康学院、凯里学院大健康学院、凯里学院大健康学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |