《表1 组装Unigene质量指标》

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《花环肉质软珊瑚与短指软珊瑚转录组初步分析》

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花环肉芝软珊瑚和短指软珊瑚不同部位的4个样本测序后组装共获得130 587条Unigene（表1）.Unigene是经过去冗余之后得到的基因序列，这条序列和其他的序列是非冗余的，也就是理论上其他序列都和此序列代表的不是同1个基因．花环肉芝软珊瑚冠部与茎部Unigene数目都超过80 000条，差异不大．短指珊瑚冠部Unigene数目远大于茎部，差异较为明显．2种不同珊瑚Unigene平均长度差异明显，花环肉芝软珊瑚的Unigene平均长度要略高于短指珊瑚．花环肉芝软珊瑚的N50（将所有Unigene从长到短排序，并依次累加长度．当累加片段长度达到总片段长度的50%时，对应片段的长度和数量，即为Unigene N50长度和数量）与GC含量都略大于短指珊瑚．从图1可以看出，Unigene的长度都≧200 nt．长度在200～299 nt的Unigene数目为25 420条，长度为300～399 nt的Unigene数目为13700条，而长度在2 900～2 999 nt的Unigene数目仅为643条．