《表1 Unigene的质量指标》
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《阴地蕨全转录组分析及植物激素信号转导相关基因筛选》
注:N50.按Unigene长度从大到小排序后逐个累加至所有Unigene,总长度的50%时,最后一个累加的数值大小即为N50;N70、N90以此类推。GC(%).碱基G和C的比例。
使用Illumina Hiseq平台一共测得总原始序列(raw reads)数据量为55.52 Mb,过滤后得到干净序列(clean reads)44.45 Mb,clean reads比率达到80.6%,测序深度属“深度”(high deep,>15 Mb)测序。得到干净总碱基数6.67 Gb,组装后得到58 646个Unigene,平均长度1 023 bp,N50、N70均大于1 000 bp(表1)。所有Unigene的长度均大于300 bp,分布在300~400 bp的最多,占25.5%,大于1 000 bp的累计占39%(图1),说明测序连续性和组装效果较好。
图表编号 | XD00156930200 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.04.01 |
作者 | 张林甦、韩忠耀、王传明、邓先扩 |
绘制单位 | 黔南民族医学高等专科学校药学系、黔南民族医学高等专科学校药学系、黔南民族医学高等专科学校药学系、黔南民族医学高等专科学校药学系 |
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