《表1 氨基酸代谢模型参数值》

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《玉米浆发酵产生物丁醇的氨基酸代谢动力学模拟》

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注：XR：木糖还原酶；rpi A：核糖5-磷酸异构酶A；Pur M：嘌呤代谢；rib A：环化水解酶II；DPO1：二磷酸核苷激酶；TKTa：转酮醇酶；PFK：磷酸果糖激酶；GAPDH：甘油醛-3-磷酸脱氢酶；PGK：磷酸甘油酸激酶；PK：丙酮酸激酶；LDH：乳酸脱氢酶；PFOR：铁氧还蛋白氧化还原酶；PTA：磷

基于Zhao等[10]建立的丙酮丁醇梭菌ABE发酵的碳动态代谢模型，增加氨基酸代谢网络，用以描述玉米浆为底物的氨基酸动态代谢过程。用Michaelis-Menten方程描述了各通量的动力学和细胞的比生长速率。化学反应计量关系、代谢通量动力学方程和质量平衡方程参考Zhao等[10]的研究确定。根据Rizzi等[17]提出的方法确定模型结构和动力学参数，并通过最小二乘法优化模拟结果。通过定义试验值与模拟值之间残差的加权平方和为目标函数，在参数变化范围内优化函数最小值得到参数值。根据在MATLAB中输入模型的参数值（见表1）和代谢物初始值（见表2）进行动态代谢模型模拟得到氨基酸消耗模拟曲线。运用MATLAB R2018b进行动态代谢模型模拟及数据分析，运用Canoco5对数据进行相关性分析。