《表1 甲基化检测模板、引物及探针的序列》

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《基于核酸侵入反应偶联PCR的粪便样本基因甲基化定量分析方法及用于结直肠癌无创筛查》


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注:下划线部分表示Flap片段序列,与模板不互补;斜体部分为修饰的荧光基团和淬灭基团;荧光发卡探针的双下划线部分为自身形成发卡的序列。Note:Underlined sequences of detection probes are flaps and not complementary to the templates.Italicized parts are modified fluo

Rotor-Gene Q实时荧光定量PCR仪(德国QIAGEN公司);One Drop OD-1000 spectrophotometer(南京五义科技有限公司);Allegra X-30R冷冻离心机(美国Beckman Coulter公司);FEN1核酸内切酶(FEN1酶,实验室自表达[22]);Go TaqHot Start DNA聚合酶(美国Promega公司);QIAampFast DNA Stool Mini Kit(德国QIAGEN公司);EZ DNA Methylation-GoldTMKit(美国ZYMO RESEARCH公司);HCT116细胞基因组DNA(方法学建立时的甲基化模板);健康人基因组DNA(方法学建立时的非甲基化模板);其它试剂均为分析纯。寡核苷酸片段由上海Invitrogen公司合成,具体名称及序列见表1,引物和探针共覆盖8个BMP3基因甲基化检测常用的Cp G位点[8~10]。