《表6 TRβ识别序列基因组启动子区匹配结果》
注:下划线部分表示TRE序列AGGT(C/A)A.
TRαA识别文库筛选得到11个启动子区域含有TRE序列AGGT(C/A)A的候选靶基因(表5);TRβ识别文库筛选得到12个启动子区域含有TRE序列AGGT(C/A)A的候选靶基因(表6)。其中TRαA与TRβ识别文库筛选得到4个相同的候选靶基因:frizzled-3-like、tbck、aimp1和max。通过KEGG(https://www.kegg.jp/)网站对基因功能进行了分析:frizzled-3-like编码mTOR和Wnt信号通路中的转录因子,负责调节脂类生成与分解、黑色素生成、细胞周期与基因转录;tbck编码含有TBC结构域的蛋白质激酶,参与免疫突触的形成、胞质分裂和细胞自噬;aimp1参与RNA剪切与转运、转录与翻译调控、信号传导和免疫应答等多种生命活动;max编码MAPK信号通路中的转录因子,负责调节细胞的增殖分化与凋亡。预测这4个基因与牙鲆变态相关,选取这4个候选靶基因完成后续验证实验,基因信息来自中国水产科学研究院北戴河中心实验站提供的牙鲆基因组。
图表编号 | XD00160804900 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.09.01 |
作者 | 陶家康、付元帅、施志仪 |
绘制单位 | 上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室、上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室、上海海洋大学教育部水产遗传资源开发利用重点实验室、上海海洋大学上海水生动物遗传育种协同创新中心、上海海洋大学农业农村部淡水水产种质资源重点实验室、上海海洋大学教育部水产遗传资源开发利用重点实验室、上海海洋大学上海水生动物遗传育种协同创新中心 |
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