《表1 RT-PCR引物序列》

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《从化地区儿童人冠状病毒流行病学与临床特点的观察》


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按照试剂盒的说明操作,使用QIAamp MiniE-lute Virus Spin(德国QIAGEN)从200μL的喉咙和鼻拭子样本中提取病毒DNA和RNA。使用Thermo Scientific Revert Aid First绞链cDNA合成试剂盒(Thermo,USA)进行病毒RNA的反转录,过程为:25℃5 min,42℃60 min,然后70℃5 min。cDNA可立即用于病毒检测,或保存在-20℃下直至进一步使用。通过标准逆转录PCR(RT-PCR)检测冠状病毒,筛选HCoV和4种(OC43、229E,NL63,HKU1)。TaqMan实时PCR引物和探针(由Invitrogen,Life Technology,上海合成)被设计为结合高度保守的HCoV区域和相应物种,并通过Primer Express软件(3.0版,美国应用生物系统公司)进行分析(用于引物)。每个反应混合物由10μL 2×i Q Supermix反应混合物(Bio-Rad),2μL病毒cDNA,0.5μM正向和反向引物以及0.3μM探针和无核酸酶的水组成体积为20μL。对于总HCoV,实时PCR在95℃下进行5 min,然后在95℃下进行45次循环15 s,在60℃下进行1 min。对于物种229E/OC43/NL63/HKU1,在95℃下进行5 min实时PCR,然后在95℃下进行45次循环15 s,在55℃下进行1 min。然后进行45个循环,分别是95℃持续30 s,55℃15 s,60℃45 s。所有实时PCR反应均在ABI 7500实时PCR系统(美国Applied Biosystems)上进行。用于反应的引物如下,见表1。