《表1 6肽与APD数据库中已知的抗菌肽对比》
注:加粗代表相同的氨基酸残基。
对活性峰F进行LC-MS分析,由图6可见,主要信号峰出现在10.52 min,此峰所占的峰面积为95.46%,此信号峰对应二级质谱图中的母离子[M+H]+为m/z 640.3。利用MassLynx V4.1软件对二级质谱中的特征碎片峰分析,结果如图7所示,预测活性峰F是由6个氨基酸组成的小肽,序列为L-V-N-P-P-T。借助ExPasy中的ProtParam软件,在线分析该抑菌肽的分子质量为639.75 Da,分子式为C29H49N7O9,等电点为5.52,GRAVY为0.100,脂溶性指数113.33。将此多肽在NCBI、APD数据库进行同源性分析,结果如表1所示,发现与APD数据库中已报道抑菌肽的同源相似性较低,与来自链霉菌属的抗菌肽,APD ID为AP02577的氨基酸序列的同源性最高,为37.5%。由此推断,此6肽为一种新型抗菌肽。
图表编号 | XD00154674400 严禁用于非法目的 |
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绘制时间 | 2020.08.25 |
作者 | 姚佳明、田亚平 |
绘制单位 | 江南大学生物工程学院、江南大学生物工程学院 |
更多格式 | 高清、无水印(增值服务) |