《表1‘84K杨’SAMT基因的理化性质》

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《杨树SAMT基因的克隆及生物信息学分析》

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用ExPASy在线程序Protparam对SAMT编码的氨基酸序列的理化性质进行预测。结果显示（表1），SAMT蛋白的相对分子量约为40.592 kD；理论等电点（pI）为5.68，为酸性蛋白质；同时，氨基酸的不稳定性系数为44.22，说明该蛋白稳定性不高；脂溶指数为80.11。对SAMT基因序列编码的氨基酸组成分析发现（表2），构成该蛋白的有20种氨基酸，其中丝氨酸、谷氨酸、亮氨酸和缬氨酸含量最高，分别为9.1%、8.8%和8.2%（亮氨酸和缬氨酸含量相同），色氨酸的含量最低，只有0.8%；其中，带负电荷的氨基酸残基（Asp+Glu）有44个，带正电荷的氨基酸残基（Arg+Lys）有38个，说明该蛋白质有较大的可能性带负电。用ExPASy在线程序ProtScale对蛋白质的亲疏水性进行预测，结果显示（图3），正值为疏水性，在240处的天冬酰胺疏水性最强，为2.144；负值为亲水性，在227处的谷氨酸亲水性最强，为-2.656，平均亲水性为-0.180，结果表明整个蛋白具有高度的亲水性，亲水性氨基酸常位于蛋白质的外部，并易与水分子相结合，起到溶于水与蛋白折叠的功能，而疏水性氨基酸则常位于蛋白质的内部。亲水性氨基酸和疏水性氨基酸的这种特性，作用于蛋白的折叠，与大多数功能蛋白一样，‘84K杨’SAMT蛋白也是亲水性蛋白。