《表1 苦荞14-3-3基因理化性质分析》

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《苦荞14-3-3基因家族生物信息学分析》

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为了鉴定14-3-3基因家族成员，首先利用BLA-STP将14-3-3的氨基酸序列和苦荞全基因组序列进行比对，筛选出19条符合要求的氨基酸序列，然后将这些序列再进行Hmmsearch，最终得到19条14-3-3的基因家族序列，将这19条序列通过Pfam和SMART数据库进行预测鉴定，确保19条都含有14-3-3保守结构域。将这19条序列根据在染色体的位置进行命名，分别为Ft1.1、Ft1.2、Ft1.3、Ft2.1、Ft3.1、Ft4.1、Ft5.1、Ft5.2、Ft5.3、Ft5.4、Ft6.1、Ft6.2、Ft6.3、Ft6.4、Ft6.5、Ft6.6、Ft7.1、Ft7.2、Ft7.3。理化性质分析结果显示（表1），Ft5.1有3个14-3-3保守结构域，Ft1.3、Ft6.5、Ft6.6都含有2个14-3-3保守结构域，其余仅有1个；14-3-3的基因家族序列的氨基酸数目在101～242 aa之间，分子量最大值为Ft5.1的27 765.18 k D，最小值为Ft6.5的11 191.53 k D；等电点在4.27～9.59之间，Ft1.1和Ft6.4为碱性蛋白，其余为酸性蛋白；不稳定系数小于40的有6个，都为稳定蛋白；平均疏水指数仅有两个为正值，表明Ft5.1和Ft6.6为疏水蛋白，剩余蛋白质均为亲水蛋白。通过亚细胞定位分析可得，9个蛋白位于细胞质中，4个蛋白位于叶绿体中，其余少部分位于胞外、细胞核等处。